为加强基层新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控经费保障，提高疫情防控能力，连云港财政部门将提前下达2020年中央和省级基本公共卫生服务专项补助资金2.19亿元，其中2260万元将专项用于新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控工作。
根据国家和省文件精神，2020年基本公共卫生服务补助资金人均补助标准将由75元/人提高至80元/人，新增的5元标准将全部落实到乡村和城市社区，主要用于疫情防控工作，任何地方和部门不得擅自截留、挤占、挪用或改变资金用途。截止2020年2月1日，连云港各级财政部门已投入疫情防控资金9705万元。